Final Fantasy V вышла всего на год позже предыдущей части серии и во многих отношениях оказалась довольно посредственной. Тем не менее, игра отличилась крепким сюжетом и геймплеем, а также оригинальной системой работ, позволяющей заниматься кастомизацией персонажей. Всего в Японии было продано около двух миллионов копий оригинальной игры.

История игры начинается с того, что король государства Тайкун (Tycoon), обеспокоенный тем, что ветер остановился, отправляется в хранилище Ветряного Кристалла, чтобы выяснить причину катаклизма, и не возвращается. Его дочь, принцесса Ленна, обеспокоенная судьбой отца, отправляется на его поиски. В это же время на землю неподалёку от замка падает метеорит, и оказавшийся поблизости молодой путешественник Бартц отправляется проверить, что случилось. Там он сталкивается с Ленной, на которую напали гоблины, и помогает девушке справиться с ними. Принцесса посвящает его в курс событий, и Бартц решает сопровождать её, вскоре у них появляется и третий компаньон — старик Галуф, страдающий амнезией. Однако, дорога к хранилищу оказывается недоступной из-за упавшего метеора, и героям приходится воспользоваться обходным водным путём, в чём им помогает капитан пиратов Фарис. Добравшись до места назначения, персонажи обнаруживают, что кристалл разбит на кусочки. Появляется голограмма короля, который объясняет героям, что отныне они — избранные, которые должны победить Эксдэса (Exdeath) и тем самым помешать древнему злу уничтожить мир.

Вчетвером персонажи отправляются путешествовать по миру в попытках спасти оставшиеся три кристалла, но все они оборачиваются неудачей, и тогда на их пути появляется Крил, внучка Галуфа, благодаря которой к старику возвращается память. Выясняется, что он родом из параллельного мира, куда он и отправляется вместе с Крил. Оставшись втроем, Бартц, Ленна и Фарис, воспользовавшись помощью инженеров Сида и Мида, отправляются вслед за другом. После некоторых злоключений, героям наконец удаётся добраться до замка Бал (Bal), правителем которого оказывается не кто иной, как Галуф. Выясняется, что в своё время он был одним из Четырёх Воинов Рассвета и воевал со злом бок о бок с отцом Бартца. Вместе персонажи отправляются к мудрему Гидо (Ghido), гигансткой черепахе, живущей в подводной пещере, который объясняет им происхождение Эксдэса. Герои отправляются в лес Мур, к древнему дереву, где уничтожают наложенные печати. В этот момент появляется Эксдэс, обретший силу кристаллов. На помощь героям приходит Крил на своём драконе, однако Эксдэс окружает её огненным кольцом. Галуф выручает внучку и, использовав все свои силы, сражается с Эксдэсом, пока тот не отступает. От полученных ран Галуф умирает на руках у друзей, передав все свои способности Крил.

Партия отправляется в замок Эксдэса и побеждает его, однако три оставшихся кристалла разрушаются, и оба мира сливаются в один. Выясняется, что Эксдэс обрёл силу Пустоты, заключённую в пространстве между мирами, и поглощает целые города и королевства. Теперь для того, чтобы его победить героям необходимо собрать двенадцать легендарных оружий, с помощью которых тысячу лет назад был побеждён Энуо. После, добравшись до самой Пустоты, они сталкиваются с Эксдэсом, принявшим свою истинную форму — дерева, захваченного злым духом. При поддержке четырёх Воинов Рассвета и короля Тайкуна, героям удаётся выжить в Пустоте и победить Эксдэса. После этого им завладевает Пустота, превращая в Нео-Эксдэса, намеренного уничтожить все сущее, в том числе и самого себя. Персонажи вновь одерживают победу, окончательную на этот раз, и уничтоженным кристаллам возвращается их изначальная форма.

В 1994 году в Японии вышел аниме-сиквел к игре в формате OVA под названием Final Fantasy: Legend of the Crystals. Его созданием с разрешения Square занялась известная студия Madhouse Studios. Всего вышло четыре эпизода по тридцать минут каждый, занявшие две VHS кассеты. В 1998 году Final Fantasy: Legend of the Crystals было выпущено в США. Действие аниме разворачивается два столетия спустя после событий оригинальной игры, а в роли главных героев выступают совершенно новые персонажи, тем не менее, очень похожие на своих предшественников, которые отправляются против нового зла. Несмотря на то что прямой связи между игрой и сиквелом нету, последний содержит множество отсылок к оригиналу, в том числе и комедийного характера.

Руководителем проекта стал создатель Final Fantasy Хиронобу Сакагути. Дизайном персонажей и логитипа занялся до этого неоднократно работавший с серией Ёситака Амано, в то время как над монстрами потрудился тогда ещё новичок Тэцуя Номура. Как позже заявил Амано, дизайн Фарис наравне с Террой из Final Fantasy VI он считает своими лучшими работами в серии.